学部现设有教育学系、教育技术学系、学前教育系、小学教育系等，其中教育学系的办学历史悠久，是由原私立华南女子文理学院家政教育系（创办于1921年）、厦门大学教育系（创办于1922年）、福建省立师专教育科（创办于1941年）合并而成；教育技术学系的前身是福建师范大学物理系的电化教育专业，于1979年开始招生，1999年并入当时成立的教育科学与技术学院；学前教育系是在教育学系的基础上发展起来的。

福建师范大学教育学部于2019年11月17日正式揭牌。新组建的教育学部赋能统筹全校教育学科、教师教育、教育服务资源，统领学校教育学科振兴、教师教育改革和基础教育服务能力提升等工作，是福建师范大学创建国家级教师教育实验区、全国师范教育基地的重要基础平台。