为了充分发挥警方打击犯罪、保护人民、服务经济建设的职能作用，金山警方的机构设置坚持统一、精简、高效的原则。

按照业务范围设置的部门有：指挥处、政治处、警务保障处、纪委（监察室）、警务督察支队、经侦支队、治安支队、刑侦支队、出入境管理办公室、交警支队、特警支队、消防支队、法制办公室、看守所（治安拘留所）、科技科、网络安全保卫支队、人口管理办公室等20个直属机构。

按照行政区划，设置了19个基层派出所，其中石化治安派出所、水上治安派出所等2个派出所为治安派出所。