学校前身

奉天水产实业学堂

大连海洋大学的办学历史可以溯源到1906年的奉天水产实业学堂。

大连水产学院

1952年，东北人民政府整合营口、锦州、佳木斯、兴城四地的水产学校在大连成立东北水产技术学校，是新中国成立后东北地区第一所正规水产学校。在锦州农业技术学校的渔业、加工两个班的基础上，接受了兴城县分配来的初中毕业生和在大连、沈阳招考的116名学生及6名华侨学生，编成渔捞、养殖、加工、轮机四个专业科。

1953年3月，学校改由旅大市水产局领导；6月，旅大市政府正式任命旅大市水产局局长邢维真兼任校长。同年9月，经东北行政委员会农业局批准，学校改名为大连水产学校。

1958年，大连水产学校升格为大连水产专科学校。

1960年，大连水产专科学校更名辽宁省大连水产专科学校。

1963年，辽宁省大连水产专科学校更名大连水产专科学校。

1975年，大连水产专科学校、旅大水产学校、辽宁省海洋水产研究所合并组建旅大水产专科学校。

1977年，旅大水产专科学校（原大连水产专科学校部分）复校大连水产专科学校。

1978年，大连水产专科学校升格为大连水产学院。

1986年，学校获得硕士学位授予权，辽宁省委宣传部批准创办《大连水产学院学报》。

1998年，学校顺利通过教育部本科教学合格评价。

2000年，学校由农业部划转辽宁省管理。

2008年，学校在教育部本科教学工作水平评估中取得“优秀”成绩。

辽宁省农业工程学校

1973年，辽宁省农业机械化学校改建为辽宁农学院（农业机械化分院）。

1975年，辽宁农学院（农业机械化分院）、旅大农机科研所、旅大农机学校、旅大农科所、旅大农业技术训练班合并组建旅大农学院。

1977年，旅大农学院撤销。

1978年，旅大农学院（原辽宁省农业机械化学校部分）改建为辽宁省农业机械化学校。

1986年，辽宁省农业机械化学校更名辽宁省农业工程学校。

升格更名

2010年，大连水产学院更名为大连海洋大学。3月，辽宁省人民政府与国家海洋局签订协议，共建大连海洋大学。年底，学校与大连普湾新区签署搬迁项目协议，决定在大连普湾新区建设新校园。

2014年2月，大连海洋大学职业技术学院更名为大连海洋大学应用技术学院。10月，学校入选国家首批卓越农林人才教育培养计划改革试点高校。

2017年1月，学校入选辽宁省一流大学重点建设高校中的“国内高水平大学重点建设高校”。8月，经教育部批准，学校获批研究生推免资格。

2020年9月，成为全国高校海洋类学术期刊联盟理事单位；同年10月，加入“中泰高等教育合作联盟”。

2021年3月，学校获得中外导师联合培养研究生资格。

2021年5月15日，成为高等农林院校课程思政联盟理事会员单位。

2022年6月，学校以理事单位的身份加入航海类高校课程思政联盟。

2022年12月，大连海洋大学举行建校70周年发展大会，共庆建校70周年。

2024年3月，教育部公布了2023年度普通高等学校本科专业备案和审批结果，共新增审批专业点217个，学校申报的生物育种技术专业（090117tk）成功获批。

2025年3月26日，沙河口区人民政府、大连海洋大学合作办学揭牌仪式在大连市沙河口区黑石礁小学（大连海洋大学附属黑石礁小学）举行。7月9日，大连海洋大学欧美同学会（大连海洋大学留学人员联谊会）成立。