我院先后荣获全国减刑、假释、保外就医专项活动先进单位、全国检察机关文明接待室、全国检察宣传先进单位、江苏省检察机关规范执法先进单位、江苏省十佳渎检局、江苏省青年文明号、南通市先进检察院、南通市文明单位、南通市人才工作先进单位等70多项市级以上表彰奖励。

2020年10月14日，被最高人民检察院表彰为“全国先进基层检察院”。

我院党组高度重视人才培养工作，在全院干警中积极开展岗位大练兵活动，钻研业务、苦练技能蔚然成风，共有248人次受到最高检和省、市、区级的表彰，涌现出了全国优秀公诉人、全国渎检系统专项工作先进个人、全国优秀司法警察、省检察系统先进工作者、省十佳女检察官、省三八红旗手、省新长征突击手、省杰出青年卫士、省渎检系统侦查尖兵、省反贪系统优秀侦察员、市劳模、市十佳检察官等一大批先进个人。

2022年1月，入选2019-2021年度江苏省文明单位候选名单。

2023年，被最高人民检察院荣记集体一等功。

2024年2月，南通市崇川区检察院获评2023年度全省“五好”基层检察院，至此，崇川区检察院已经连续三年荣获全省“五好”殊荣。