根据上述职责，湖北长阳经济开发区管理委员会设4个内设机构。

（一）办公室

负责综合协调、文秘事务、调研督办、党务群团、电子政务、政工人事、工业统计、后勤服务、财务管理等工作。

（二）招商科

负责制定开发区产业发展规划和项目发展规划；负责制定、实施开发区内招商政策、措施和规定；负责抓好招商引资工作对外对内宣传、项目资料管理、客商信息的收集；负责开发区内项目从开工到投产的全程协调服务；负责开展对外经济协作和协作项目的洽谈、签约等工作。

（三）经济发展科

编制开发区经济和社会发展中长期规划和计划，并组织实施；负责开发区财政预结算、收支管理和国家资产管理工作；负责区内市政公用设施、市容环境、公用事业、园林绿化等综合协调、管理和服务；负责组织实施管委会投资的各项基础设施工程的建设和对建设工程进行监督管理，做好所有进区企业工程建设的配套服务和协调工作；协助县国土资源局办理辖区内的土地征用和出让手续以及土地管理等工作；负责拆迁户安置和户籍迁移等工作；协助相关部门做好辖区内的建设用地规划、建设工程规划审批和建设管理等工作；负责开发区内安全生产等工作。