根据上述职责，区商务局（粮食局）设4个职能科室:

（一）综合科

综合协调局机关日常政务；负责文秘、会务、机要、档案、信息、保密、保卫、信访、政务公开、宣传、后勤保障等工作；组织办理人大代表建议（议案）和政协提案；负责内部规章制度建设；负责局机关和指导直属单位的机构编制、组织人事、党群、教育培训、劳动工资、队伍建设、纪检监察和离退休人员服务管理等工作；承办局机关和直属单位局管干部的考核、任免、调配、奖惩等工作；负责局机关和指导直属单位的国有资产和财务管理。

（二）商贸管理科

统筹商务领域消费促进工作；推进国内市场开拓，促进市场信息平台和营销网络建设；组织起草连锁经营、商业特许经营等商贸服务业政策并组织实施；指导商贸企业营销工作；牵头负责市场商品运行统计工作，监测、分析全区市场运行和商品供求状况；负责商品市场设置布局和商业网点的管理工作；指导城乡商业网点规划制定、实施和社区商业建设，培育特色街、区；协调重大节日市场供应；组织实施应急商品市场调控和储备管理，承担全区突发公共事件生活必需品市场供应应急管理的有关工作；承担全区加油站（点）发展规划的制定并实施，承担成品油零售经营许可活动的监督管理；承担商贸服务业（含餐饮、家庭服务、住宿、理发、洗涤、照相等）的行业管理；指导餐饮、旅馆、酒店的分等定级；监督管理拍卖、典当、旧货流通等特殊流通行业；培育老字号等商贸品牌；承担百货业等传统流通业态行业管理；负责商贸系统安全生产监督管理；推进流通领域节能减排工作；指导全区商贸行业协会的管理工作。

（三）粮食管理科(挂行政审批科牌子)

负责全区粮油商业统计，研究提出总量平衡和政府调控政策建议；负责全社会粮食流通管理，开展粮食产销合作，保障军队粮油供应；负责拟订“订单粮食”收购政策并做好收购工作；负责地方储备粮油管理和购销、保管、调拨、轮换工作；组织开展粮食仓储规范化管理工作；负责粮食收购资格行政许可审批；负责粮食供求和市场价格监测及安全预警，健全粮食供给安全应急机制；协同有关部门做好粮油质量、价格和卫生安全的监管；负责对粮食收购资格进行核查监管；会同有关部门研究制定粮食财政补贴、粮食风险基金和粮食专项资金的管理和使用政策；负责制定粮食补贴资金拨补办法；负责酒类流通备案登记；承担区粮食安全工作协调小组办公室日常工作，协调各成员单位对粮食安全责任制考核指标的确定和检查考核。

（四）蔬菜副食品管理科

组织指导“三绿工程”（绿色消费、绿色市场、绿色通道）；负责“菜篮子”商品流通的行业指导和管理；组织实施全区“菜篮子”工程的规划和建设工作；负责区级“菜篮子”基地建设管理工作，促进科技兴菜；组织落实“菜篮子”流通政策；指导主要“菜篮子”商品产销对接；实施重要“菜篮子”商品应急储备和市场调控；负责全区生猪定点屠宰的监督管理；建设主要“菜篮子”商品检测监管网络和追溯体系，保障“菜篮子”商品质量安全；组织实施菜市场规划、建设和管理，开展市场诚信文明体系建设；负责酒类流通监督检查；指导全区“菜篮子”行业协会的管理工作。